现在，上海分公司分为独立核算分公司和非独立核算分公司。

1、独立核算分公司：分公司与总公司财务独立核算，分公司可以在当地开发票并在当地报税。

2、非独立核算分公司：分公司财务不独立核算，分公司不可以开发票，开票和报税在总公司。

以前内资公司办事处或代表处现在统称为非独立核算分公司。

一、上海分公司注册所需材料是：

1、总公司营业执照副本复印件（需加盖公章）

2、总公司国税、地税登记证复印件（同上）

3、总公司组织机构代码证复印件（同上）

4、总公司验资报告复印件（同上）

5、总公司章程（同上）

6、股东会决议（所有股东签字）

7、法定代表人身份证复印件及照片

8、上海负责人任命书

9、上海负责人身份证复印件及照片

10、上海负责人工作简历

11、上海分公司（办事处）办公场所的租赁合同原件

12、上海分公司（办事处）办公场所的房产证复印件

13、上海分公司财务人员身份证与上岗证复印件

14、委托本公司代理办理的委托书

二、上海分公司注册流程：

1、上报工商局查名

2、办理营业执照及刻章

3、办理组织机构代码证

4、办理税务登记证

三、上海分公司注册时间：

1、上报工商局查名 3个工作日

2、办理营业执照及刻章 7个工作日

3、办理组织机构代码证 1个工作日

4、办理税务登记证 25个工作日

四、上海分公司注册费用

1、政府费用：1500元人民币左右。

2、代理费用：普票2000元人民币，一般纳税人3000元人民币(独立核算分公司可以注册在开发区,享受开发区的税收优惠政策)。